Мовою освітнього процесу в Перегінському ліцеї №2  є українська мова.

У відповідності до ст. 7 Закону України “Про освіту”:

• – держава гарантує кожному громадянинові України право на здобуття формальної освіти на всіх рівнях (дошкільної, загальної середньої, професійної (професійно-технічної), фахової передвищої та вищої), а також позашкільної та післядипломної освіти державною мовою в державних і комунальних закладах освіти;
• – особи, які належать до національних меншин України, мають право на навчання в школі для здобуття дошкільної та початкової освіти, поряд із державною мовою, мовою відповідної національної меншини. Це право реалізується шляхом створення відповідно до законодавства окремих класів (груп) з навчанням мовою відповідної національної меншини поряд із державною мовою і не поширюється на класи (групи) з навчанням українською мовою;
• – особам, які належать до корінних народів України, гарантується право на навчання в школі для здобуття дошкільної і загальної середньої освіти, поряд із державною мовою, мовою відповідного корінного народу. Це право реалізується шляхом створення відповідно до законодавства окремих класів (груп) з навчанням мовою відповідного корінного народу України поряд із державною мовою і не поширюється на класи (групи) з навчанням українською мовою;
• – особам, які належать до корінних народів, національних меншин України, гарантується право на вивчення мови відповідних корінного народу чи національної меншини в школі або через національні культурні товариства.

У школі відповідно до освітньої програми та рішення педагогічної ради школи вивчаються дві іноземні мови – англійська і німецька.

Першою іноземною мовою для вивчення учнями, починаючи з 1-го класу, визначена англійська мова.

Другою іноземною мовою для вивчення учнями, починаючи з 5-го класу, визначена німецька мова.